Validité du diagnostic clinique des principales affections des animaux d’élevage : étude de concordance avec le diagnostic de laboratoire dans un contexte sahélien au Niger

Résumé

La fiabilité du diagnostic clinique constitue un enjeu majeur pour la gestion sanitaire des animaux d’élevage, particulièrement dans les contextes sahéliens où l’accès aux examens complémentaires demeure limité. Cette étude a pour objectif d’évaluer la concordance entre le diagnostic clinique et le diagnostic de laboratoire des principales affections rencontrées chez les animaux d’élevage et d’identifier les facteurs associés aux discordances diagnostiques dans la région de Tahoua, au Niger. Une étude observationnelle transversale de validation diagnostique a été réalisée sur 53 animaux comprenant principalement des ovins, des caprins et des bovins. Chaque animal a fait l’objet d’un examen clinique suivi de prélèvements sanguins et/ou fécaux analysés au laboratoire par des examens coprologiques et hématologiques. Les performances du diagnostic clinique ont été évaluées à partir de la sensibilité, de la spécificité, des valeurs prédictives, de l’exactitude, du coefficient Kappa de Cohen et du test de McNemar. Les facteurs associés aux discordances ont été analysés par le test exact de Fisher et une régression logistique pénalisée de Firth. Les résultats ont révélé une importante sous-détection des affections par l’examen clinique seul. Le parasitisme représente l’affection la plus fréquemment confirmée au laboratoire (83,0 % contre 20,8 % cliniquement), suivi des affections hématologiques (71,7 % contre 0 %), digestives (54,7 % contre 30,2 %) et bactériennes/inflammatoires (52,8 % contre 20,8 %). Les performances diagnostiques sont  globalement faibles, avec une absence d’accord pour le parasitisme et les affections hématologiques, et un accord seulement faible pour les autres catégories. Le type de prélèvement constitue le principal facteur associé aux discordances diagnostiques, notamment pour les affections parasitaires et hématologiques. Cette étude met en évidence les limites du diagnostic clinique seul en médecine vétérinaire de terrain et souligne l’importance des examens de laboratoire pour améliorer la précision diagnostique et la prise en charge sanitaire des animaux d’élevage en contexte sahélien.

Mots clés: Diagnostic clinique, affections des animaux, diagnostic de laboratoire, sous-détection, sahel, Niger