Résumé

Les viroïdes sont des agents transmissible mécaniquement et par greffage, et disséminés à  longue distance par le matériel végétal. Des prospections ont été menées, durant Juillet 2013, dans la région du Gharb à  la recherche des viroïdes des agrumes. Un total de 53 échantillons a été collecté et utilisé pour l'inoculation du cédratier 'Etrog' avant d'être testé par RT-PCR pour la détection de l'exocotris (Citrus exocortis viroid, CEVd). Les résultats obtenus ont montré que le CEVd a été très répandu dans la région avec un pourcentage d'infection de 84,9 % des échantillons analysés. Après le séquençage génomique, une étude de la diversité génétique a été réalisée sur trois isolats locaux représentatifs du CEVd. La comparaison entre les séquences nucléotidiques marocaines du CEVd a montré une diversité génétique inférieure à  3 %.


Mots-clés: Agrumes, Citrus exocortis viroid, RT-PCR, séquençage, Gharb.